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Lors de leur congrès annuel 2023 à Lausanne, les néphrologues suisses ont donné une vue d’ensemble passionnante de leurs recherches très diversifiées. Nous vous présentons ici quelques-uns de ces travaux.
Apprentissage automatique: modèles de prédiction du type de calculs rénaux et du risque de récidive
Contexte: Les calculs rénaux sont très répandus et entraînent une morbidité ainsi que des coûts élevés. Le traitement dépend du type de calcul et du risque de récidive. Nous avons émis l’hypothèse que les méthodes d’apprentissage automatique (AA) offraient une plus grande précision dans la prédiction du type de calcul et du risque de récidive par rapport aux approches actuelles.
Méthode: Les données de trois cohortes suisses largement phénotypées de 1505 patients présentant des calculs rénaux ont été incluses, pour lesquelles des données démographiques, anthropométriques et cliniques ainsi que des analyses de la composition des calculs et des mesures des urines de 24 heures étaient disponibles. Plusieurs modèles AA supervisés, dont la régression logistique, le «parallel tree boosting» (XGBoost), les «random forest» aléatoires et les réseaux neuronaux, ont été entraînés indépendamment pour prédire le type de calcul et le risque de récidive à 5 ans.
Résultats: Le modèle XGBoost a généralement atteint une spécificité élevée (>90%), sauf pour les calculs d’oxalate de calcium, pour lesquels une sensibilité plus faible a été observée. L’algorithme a atteint une précision de 85% pour la distinction entre les calculs d’acide urique et ceux de phosphate de calcium. Parmi les principales caractéristiques prises en compte dans le modèle figuraient l’âge au moment des premiers calculs, l’IMC, le calcium dans les urines de 24 heures et le pH. Le risque de récidive à 5ans prédit par le réseau neuronal se situait entre 48% et 83%, et correspondait au risque de récidive observé (R2=0,913).
Conclusion: Les modèles d’apprentissage automatique développés ont montré une précision remarquable dans la prédiction du risque de récidive de calculs. Ces résultats ont le potentiel de répondre à un besoin clinique non satisfait en aidant les professionnels de la santé à prendre des décisions cliniques et, en fin de compte, à améliorer les résultats ainsi que la qualité de vie des patients souffrant de calculs rénaux récurrents.
Infections des voies urinaires à E. coli et Klebsiella productrices de BLSE après une transplantation rénale
Contexte: Les entérobactéries sont souvent responsables d’infections des voies urinaires (IVU) chez les receveurs de transplantation rénale. De plus en plus souvent, des Escherichia coli ou Klebsiella ssp. productrices de BLSE (bêtalactamases à spectre élargi) sont détectées. Cependant, il existe peu de données sur la fréquence et l’impact des infections des voies urinaires dues à des bactéries productrices de BLSE sur les résultats de la transplantation.
Méthode: À l’aide des données de 1482 transplantations rénales réalisées entre janvier 2012 et décembre 2017, et enregistrées dans la Swiss Transplant Cohort Study, la fréquence et les effets des IVU à E.coli et/ou Klebsiella ssp. productrices de BLSE ont été analysés au cours de la première année après la transplantation. Les auteurs se sont concentrés uniquement sur les receveurs de transplantation rénale ayant présenté au moins une IVU à E.coli et/ou Klebsiella ssp.
Résultats: 389/1482 (26%) patients ont présenté au moins une IVU à E.coli et/ou Klebsiella ssp. Des souches productrices de BLSE ont été détectées dans un total de 139/825 (17%) événements d’IVU au cours de la première année chez 69/389 (18%) receveurs de transplantation. Ni les phénotypes d’IVU (colonisation, IVU et sepsis urinaire) ni la proportion de tous les événements d’IVU au fil du temps ne différaient des infections dues à des souches non productrices de BLSE. Les hospitalisations ont toutefois été plus fréquentes en cas d’IVU dues à des souches productrices de BLSE (39% par rapport à 26%; p=0,04). Les receveurs de transplantation ayant présenté au moins une IVU due à une souche productrice de BLSE au cours de la première année ont eu plus souvent des IVU récidivantes (33% par rapport à 18%; p=0,02). Aucune différence significative n’a cependant été observée entre les patients avec et sans souches productrices de BLSE en ce qui concerne la fonction rénale à un an ainsi que la survie à plus long terme du greffon et du patient.
Conclusion: Les infections des voies urinaires à E.coli et/ou Klebsiella ssp. productrices de BLSE au cours de la première année après une transplantation rénale sont associées à un risque plus élevé d’hospitalisation, mais n’ont aucun impact, ni sur la fonction du greffon, ni sur la survie du greffon et du patient.
Décharge du ventricule gauche et remodelage inversé après une transplantation rénale
Contexte: Les maladies cardiovasculaires sont l’une des principales causes de mortalité chez les receveurs de transplantation rénale (RTR). Cette étude visait à déterminer si les modifications cardiaques associées à une maladie rénale en phase terminale étaient réversibles après une transplantation rénale. En outre, la valeur pronostique de l’échocardiographie transthoracique (ETT) préopératoire a été évaluée pour la prédiction des événements indésirables cardiovasculaires majeurs (MACE).
Méthode: Les auteurs ont analysé rétrospectivement les données cliniques et d’ETT des RTR adultes inclus dans l’étude Swiss Transplant Cohort Study entre 2008 et 2019, et suivis jusqu’en 2021. L’analyse actuelle a porté sur des RTR de l’hôpital cantonal de Saint-Gall ainsi que des hôpitaux universitaires de Bâle, Genève et Zurich, pour lesquels des ETT préopératoires avaient été réalisées deux ans maximum avant la transplantation. Le critère d’évaluation primaire était le premier MACE postopératoire. Une analyse de régression de Cox univariée pour MACE a été réalisée pour les paramètres ETT et les facteurs de risque habituels, tels que les données démographiques du receveur et du donneur, l’IMC, la pression artérielle, le cholestérol, l’HbA1c, le tabagisme et l’évolution de la maladie. Enfin, les modifications échocardiographiques ont été analysées à l’aide d’un test t apparié dans un sous-groupe de patients ayant subi des ETT répétées dans les 0,5 à 2 ans suivant la transplantation.
Résultats: Sur un total de 2149 RTR, 676 avaient des données échocardiographiques préopératoires valides (âge moyen [SD]: 51,2 [13,7] ans; 452 [66,9%] hommes). Parmi eux, 138 (24,6%) ont subi un MACE (38 événements mortels et 123 événements non mortels) au cours d’une durée de suivi médiane de 2,4 ans. Dans une analyse univariée, en plus des facteurs de risque habituels (âge, diabète, hyperlipidémie et MACE antérieurs), une fraction d’éjection du ventricule gauche (VG) plus faible ainsi qu’un plus grand diamètre de l’oreillette gauche, un plus grand diamètre du VG en fin de systole et un indice de masse du VG plus élevé étaient significativement associés à un MACE après la transplantation. Les paramètres ETT appariés avant et après la transplantation ont montré une diminution significative du diamètre en fin de systole et de diastole du VG, de l’indice de volume en fin de diastole et de l’indice de masse du VG, avec une durée de suivi médiane de 1,2 an.
Conclusion: Dans cette cohorte, la transplantation rénale était associée à une décharge du ventricule gauche et à un remodelage inversé. Les résultats indiquent également que les paramètres structurels et fonctionnels du VG peuvent aider à établir un pronostic après la transplantation.
Hémodialyse incrémentale: la fonction rénale résiduelle diminue plus rapidement chez les patients diabétiques
Contexte: La fonction rénale résiduelle (FRR) est mieux préservée avec l’hémodialyse incrémentale (I-HD) qu’avec l’HD conventionnelle réalisée trois fois par semaine (TW-HD). La présence d’un diabète est associée à une diminution plus rapide de la FRR lors de la TW-HD. L’objectif de cette étude était d’analyser la diminution de la FRR à un an chez les patients diabétiques par rapport à ceux non diabétiques qui commencent par une I-HD.
Méthode: Une cohorte constituée de manière prospective a été analysée à l’hôpital universitaire de Genève. Elle comprenait tous les adultes qui ont commencé une I-HD entre janvier 2013 et juillet 2022. Les critères d’évaluation étaient la poursuite de la dialyse incrémentale à un an et la diminution de la FRR à un an (ou le passage à la TW-HD) en fonction de la présence ou non d’un diabète.
Résultats: Sur 289 patients qui ont débuté une hémodialyse, 106 ont commencé par l’I-HD, dont 38 étaient diabétiques. Au début de la dialyse, l’âge, le DFGe, le score de comorbidité, la diurèse quotidienne et la clairance de l’urée (CU) étaient comparables chez les patients diabétiques et non diabétiques. Le délai moyen de passage à la TW-HD était de 16±14 mois chez les patients non diabétiques et de 11±9 mois chez ceux diabétiques (p=0,03). À un an, 49% des patients non diabétiques n’étaient pas passés à la TW-HD par rapport à 40% des patients diabétiques (p=0,046). À un an, la diminution de la diurèse quotidienne chez les patients non diabétiques ou diabétiques était, respectivement, de 31% et 38% (p=0,26), et la diminution de la CU de 34% et 45% (p=0,07).
Conclusion: Sous hémodialyse incrémentale, la fonction rénale résiduelle diminue plus rapidement chez les patients diabétiques que chez ceux non diabétiques, et le délai de passage à la TW-HD est plus court chez les patients diabétiques. Les néphrologues doivent être conscients que la passage à la TW-HD pourrait être plus rapide chez les patients diabétiques.
Le chocolat noir réduit l’index de résistance rénale
Contexte: La consommation de chocolat en Suisse est l’une des plus élevées au monde, mais son impact sur la santé n’est pas encore totalement clair. Le chocolat noir (CN) est riche en calories, mais aussi en cacao, une substance aux effets antioxydants et antihypertenseurs. Sa consommation entraîne une vasodilatation coronarienne, mais les effets sur l’hémodynamique rénale sont inconnus. L’objectif de cette étude randomisée contrôlée par placebo était de déterminer si la consommation de CN entraînait des modifications de la circulation rénale. Celle-ci a été mesurée par échographie Doppler, aussi bien au repos que pendant une stimulation sympathique.
Méthode: 117 participants en bonne santé ont été randomisés pour consommer soit 1g de CN/kg (70% de cacao), soit 1g de chocolat blanc (CB)/kg. L’index de résistance rénale (RRI), une mesure de la résistance vasculaire intrarénale, a été mesuré immédiatement avant et deux heures après la consommation de chocolat. La pression artérielle et la fréquence cardiaque ont été mesurées à l’aide du dispositif Finapres®. Lors de chaque mesure, un test de préhension pendant 3 minutes a également été effectué en tant que stimulus sympathique; d’autres valeurs RRI ont été mesurées pendant le test. Deux semaines plus tard, les mêmes études ont été répétées avec l’autre type de chocolat.
Résultats: La consommation de CN a réduit le RRI de 0,62±0,04 à 0,60±0,04 (p=0,039), alors que le RRI n’a pas changé après la consommation de CB (avant: 0,62±0,05; après: 0,62±0,04; p=0,47). Aucune modification de la pression artérielle n’a été observée. Le test de préhension a également entraîné une réduction du RRI, tant avant qu’après la consommation de chocolat, en particulier chez les participants de <35 ans, alors que la pression artérielle augmentait. Chez les femmes, l’effet du test sur le RRI a été atténué par la consommation de CN.
Conclusion: La consommation de chocolat noir a entraîné une réduction immédiate du RRI, ce qui indique une vasodilatation intrarénale, tandis que le chocolat blanc n’a eu aucun effet. De manière surprenante, le test de préhension a également entraîné une diminution du RRI, en particulier chez les jeunes participants. Il convient d’étudier de manière plus approfondie s’il s’agit d’un signe de vasodilatation intrarénale induite par le système nerveux sympathique ou d’une réactivité vasculaire.
L’ADN mitochondrial comme biomarqueur de l’atteinte rénale du lupus érythémateux systémique
Contexte: Les lésions rénales sont très importantes dans le lupus érythémateux systémique (LES). Un dysfonctionnement mitochondrial joue un rôle important dans la physiopathologie du LES, notamment en cas d’atteinte rénale. Des modifications de l’ADN mitochondrial circulant pourraient indiquer d’un trouble métabolique dans le LES, en particulier chez les patients atteints de néphropathie lupique. Les auteurs ont donc étudié le rapport entre l’ADN mitochondrial (mt) et l’ADN nucléaire (nuc) dans le sang total de patients atteints de LES par rapport à des témoins en bonne santé, ainsi qu’au sein du groupe de patients atteints de LES avec et sans atteinte rénale.
Méthode: Tous les patients atteints de LES étaient des adultes recrutés à l’hôpital universitaire de Lausanne dans le cadre de l’étude de cohorte suisse sur le LES et pour lesquels des données cliniques ainsi que des échantillons de sang total correspondants étaient disponibles. L’atteinte rénale du lupus était définie par un DFGe <60ml/min et/ou une protéinurie >0,7g/j. Les témoins étaient des participants suédois. Après l’extraction de l’ADN, le rapport ADNmt/nuc a été déterminé en divisant le nombre de copies du gène ND1 par le nombre de copies du gène EIF2C1. Un modèle de régression logistique a été utilisé avec le rapport ADNmt/nuc comme variable dépendante et les caractéristiques du LES ont servi de covariables.
Résultats: Sur les 195 patients atteints de LES, 168 (88%) étaient des femmes. L’âge moyen était de 42 ans (IQR: 34–54). La durée moyenne de la maladie était de 97 mois (37–194) et 61 (31%) des patients présentaient une atteinte rénale. La médiane du SLE Disease Activity Index (SLEDAI) était de 4 points (2–9). Le DFGe médian était de 93ml/min (77–114) avec une protéinurie moyenne de 1±3,3 g/j. Le rapport ADNmt/nuc était plus faible chez les patients atteints de LES par rapport aux témoins en bonne santé (médiane: 129 [113–151] par rapport à 119 [99–144]; p=0,001). Dans le cas du LES avec atteinte rénale, le rapport ADNmt/nuc était encore plus faible que dans le cas du LES sans atteinte rénale (médiane: 105 [86–133] par rapport à 123 [105–149]; p<0,001). L’association avec un rapport ADNmt/nuc réduit dans le lupus rénal a persisté après ajustement pour l’âge, le DFGe, la protéinurie, la numération leucocytaire, la concentration d’hémoglobine, la numération plaquettaire et le SLEDAI.
Conclusion: Le LES, en particulier le lupus rénal, est associé à une réduction du rapport ADNmt/nuc dans le sang total, ce qui indique un dysfonctionnement mitochondrial. L’ADNmt s’avère être un biomarqueur prometteur pour l’évaluation et le traitement de l’atteinte rénale dans le LES.
Source:
Congrès annuel de la Société Suisse de Néphrologie (SGN/SSN), 7 et 8 décembre 2023, Lausanne
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